يهدف المعمل في حدود قوانين واللوائح والقرارات المنظمة لذلك إلى:-

1. التعاون مع قطاعات المجتمع المختلفة لمكافحة الامراض التي تهدد الثروة الحيوانيه والداجنة والسمكية ولزياده الانتاج الحيواني والداجني والسمكي.
2. إجراء التحاليل والاختبارات التشخيصية التي تخدم المجتمع المحلي والدولي في مجال الطب البيطري وغيرها من المجالات الطبية
3. المعاونة في مجال تدريب الطلاب والباحثين في المجالات العلمية والتطبيقية.
4. تقديم الاستشارات العلمية في الجوانب المختلفة التي تخدم الطب البيطرى والمجالات المرتبطة بها.
5. تقديم الخبرة والمشورة العلمية فيما يتعلق بالمشاكل البيئيه .
6. اصدار النشرات العلمية الدورية وعقد الندوات والمؤتمرات في مجال التخصص.
7. تنفيذ كل ما يوكل للمعمل من مشروعات سواء من الجامعة أو من خارجها توثيقاً للروابط الثقافية بعد أخذ الموافقات اللازمة.