قسم طب الحيوان هو أحد الاقسام الاكلينيكية بالكلية ويضم مادتي أمراض الباطنة والأمراض المعدية ويهتم القسم بدراسة الأمراض الباطنة والمعدية التي تصيب المجترات الكبيرة والصغيرة والخيول وايضا الحيوانات الأليفة . يقدم القسم العديد من البرامج لطلاب مرحله البكالوريوس ولطلاب الدراسات العليا، حيث انضم حديثاَ برنامج طب وجراحة الحيوانات المنزلية الاليفة لطلاب مرحلة البكالوريوس والذي يخرج طبيب بيطري متخصص في الحيوانات الاليفة
يلعب القسم دور هام في خدمة المجتمع من خلال الدورات التدريبية و الانشطة التوعوية و المشاركة في القوافل البيطرية والتي تساهم بشكل هام في خطه فخامه رئيس الجمهورية لتنميه الريف المصري من خلال مبادرة "حياة كريمة".
وللقسم اسهامات ومشاركات دوليه من خلال العديد من الدورات التدريبية والمشاريع الدولية المشتركة مع بعض الأساتذة من الجامعات والدول الأوربية بهدف نقل الخبرات وتنمية المهارات البحثية والعلمية لأعضاء هيئه التدريس